164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3533 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3533  globin  100 
 
 		 149 aa  306  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  74.45 
 
 		 133 aa  213  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  78.69 
 
 		 127 aa  206  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  76.42 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  66.43 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  68.5 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  63.04 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  66.92 
 
 		 150 aa  181  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  68.85 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  63.71 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  68.91 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  60.74 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  61.83 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  63.41 
 
 		 188 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  61.07 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  63.33 
 
 		 357 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  59.02 
 
 		 124 aa  159  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  61.34 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  60.83 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  57.48 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  59.5 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  54.55 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  58.54 
 
 		 178 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  56.56 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  61.02 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  59.17 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  60.5 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  58.68 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  55.65 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  58.54 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  56 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  56 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  56 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  56.45 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  57.26 
 
 		 136 aa  133  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  51.13 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  47.06 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  45 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  44.63 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  41.32 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  42.62 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  39.84 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  40.65 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  39.84 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  36.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  36.44 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  35.59 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  34.75 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  41.18 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  41.49 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  35.43 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  41.44 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  39.84 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  32.76 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  32.76 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  37.93 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  37.72 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  34.88 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  35.83 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  35.25 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  36.44 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  36.44 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  28.46 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  34.43 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  28.57 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  34.96 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  34.71 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  27.69 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  36.13 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  27.69 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  34.71 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  26.62 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  35.71 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  26.06 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  34.43 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  36.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  29.92 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  31.71 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  37.39 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  28.57 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  33.88 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  37.39 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  36.46 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  26.98 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  32.23 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  34.29 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  37.19 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  26.19 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  25.4 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  25.4 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  34.68 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>