158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2168 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2168  globin  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  91.97 
 
 
137 aa  263  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  69.67 
 
 
127 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  68 
 
 
133 aa  187  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  72.5 
 
 
129 aa  183  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  63.04 
 
 
149 aa  183  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  59.18 
 
 
153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  67.74 
 
 
148 aa  180  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  66.67 
 
 
127 aa  179  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  64.46 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  62.1 
 
 
188 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  64.17 
 
 
357 aa  164  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  61.98 
 
 
173 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  60.63 
 
 
142 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  58.91 
 
 
132 aa  161  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  59.5 
 
 
127 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  58.27 
 
 
142 aa  158  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  60.83 
 
 
135 aa  157  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  55 
 
 
140 aa  153  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  57.48 
 
 
132 aa  151  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  56.2 
 
 
124 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  52.52 
 
 
139 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  52.63 
 
 
145 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  56.25 
 
 
132 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  58.87 
 
 
153 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  50.34 
 
 
178 aa  147  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  58.82 
 
 
129 aa  147  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  54.55 
 
 
127 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  52.24 
 
 
136 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  52.24 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  53.44 
 
 
131 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  53.44 
 
 
131 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  53.44 
 
 
131 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  55.65 
 
 
136 aa  135  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  53.23 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  50.81 
 
 
129 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  47.5 
 
 
133 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  46.67 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  45.38 
 
 
125 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  42.74 
 
 
130 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  40.16 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  39.52 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  39.17 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  39.17 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  38.33 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  38.33 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  38.33 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  38.33 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  38.33 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  38.66 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  38.33 
 
 
132 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  38.33 
 
 
132 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  37.82 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  38.14 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  38.14 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  37.17 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  36.8 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  37.19 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  36.67 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  36 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  39.81 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  36.51 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  36.61 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  35.2 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  34.15 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  35.25 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  32.84 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  36.45 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  34.4 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  34.15 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  38.05 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  36.89 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  32.61 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  35.71 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  35.35 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  34.34 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  29.41 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  31.45 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  34.19 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  37.5 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  32.79 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  28.57 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  36.27 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  32.79 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  31.88 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  32 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  35.65 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  28.57 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  29.09 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  31.86 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  34.38 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  28.57 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  33.04 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  30.89 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  34.78 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  33.04 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  36 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  34 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>