49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3117 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3117  globin  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  78.66 
 
 		 163 aa  259  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  66.87 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  66.26 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  65.03 
 
 		 158 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  64.42 
 
 		 158 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  59.33 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  61.54 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  44.83 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  51.79 
 
 		 139 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  43.66 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  40.97 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  43.8 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  39.66 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  42.48 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  33.57 
 
 		 143 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  39.29 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  39.84 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  38.79 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  34.21 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  37.17 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  28.19 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  33.63 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  34.45 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  29.37 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  30.7 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  29.31 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  27.43 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  27.43 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  27.43 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  29.91 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  33.04 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  28.46 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  26.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  27.19 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  25 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  25.86 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  28.18 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  25.86 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  30.63 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  29.17 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  26.88 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  24.53 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  29.37 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  29.37 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  25.6 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  26.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  22.61 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>