57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4821 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4821  globin  100 
 
 
108 aa  217  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  69.16 
 
 
121 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  61.9 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  39.81 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  36.19 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  33.65 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  33.65 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  37.62 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  33.65 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  32.38 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  32.38 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  32.38 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  37.14 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  29.91 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  34.38 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  30.21 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  33.72 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  41.54 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  34.04 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  34.04 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  35.56 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  32.18 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  32.18 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  31.37 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  31.43 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  29.17 
 
 
163 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  34.72 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  29.36 
 
 
127 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  29 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  26.21 
 
 
143 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  24.04 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  29.17 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  28.09 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  26.04 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  26.04 
 
 
158 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  27.08 
 
 
158 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  26.92 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  26.04 
 
 
158 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  31.91 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  26.85 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  24.51 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  27.14 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  33.82 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  26.17 
 
 
133 aa  43.5  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  26.42 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  22.33 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  34.29 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  27.47 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  25.23 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  22.92 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  27.18 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  28.24 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  25.96 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  26.19 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  30.85 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1581  globin  29.47 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  23.26 
 
 
143 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>