63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1809 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  100 
 
 
143 aa  299  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  52.24 
 
 
144 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  38.52 
 
 
140 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  38.41 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  36.92 
 
 
143 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  39.34 
 
 
139 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  33.77 
 
 
158 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  33.77 
 
 
158 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  33.57 
 
 
158 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  34.9 
 
 
163 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  34.42 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  33.77 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  38.17 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  31.39 
 
 
146 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  33.33 
 
 
175 aa  87.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  32.26 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  30.7 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  31.75 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  31.5 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  31.86 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  28.87 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  29.2 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  29.2 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  29.2 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  30.97 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  31.3 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  27.59 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  31.36 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  28.7 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  28.95 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  27.34 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  24.22 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  25.74 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  30.84 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  27.19 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  27.19 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  30.43 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  23.44 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  25.45 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  28.21 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  23.48 
 
 
121 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  25.23 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  24.79 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  30.85 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  29.2 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  23.16 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  28.57 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  22.02 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  30 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  25.38 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  25.22 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  25.44 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  27.03 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  27.43 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  21.67 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  22.47 
 
 
125 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  25.44 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  25.44 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  22.92 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  28.32 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  21.88 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  21.67 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  30.3 
 
 
136 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>