50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1232 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  55.47 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  43.06 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  45.9 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  42.57 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  42.57 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  41.84 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  42.14 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  42.18 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  39.86 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  41.54 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  40.54 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  43.85 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  39.73 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  37.5 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  38.98 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  34.81 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  32.12 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  34.03 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  32.14 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  37.5 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  29.06 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  29.57 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  27.05 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  26.72 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  26.72 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  26.72 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  26.09 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  28.32 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  26.96 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  26.55 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  24.56 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  30.17 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  27.17 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.5 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  26.89 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  26.8 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  22.61 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  28.85 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  30.85 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  27.08 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  26.67 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  31.91 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  29.7 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  24.6 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  27.05 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  27.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  23.81 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  24.51 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  24.79 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>