120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4165 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4165  globin  100 
 
 
128 aa  258  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  62.61 
 
 
121 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  62.61 
 
 
121 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  62.61 
 
 
121 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  53.33 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  50.43 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  45.76 
 
 
141 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  42.37 
 
 
121 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  43.97 
 
 
119 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  38.66 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  36.84 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  42.31 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  36 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  47.37 
 
 
124 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  33.63 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  37.38 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  37.19 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  37.5 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  34.21 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  34.21 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  33.65 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  33.62 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  32.48 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  28.93 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  30.25 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  31.36 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  30.51 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  30.7 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  31.3 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  28.7 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  30.7 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  31.4 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  36.59 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  35.09 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  37.5 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  29.82 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  27.05 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  28.81 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  28.93 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  33.04 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  28.93 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  27.19 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  30 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  33.91 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  32.35 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  26.32 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  27.69 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  26.32 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  29.23 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  27.2 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  32.32 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  26.92 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  26.92 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  38.38 
 
 
125 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  32 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  29.55 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  27.83 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  36.89 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  26.55 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  28.69 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  27.59 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  29.55 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.31 
 
 
252 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  28.32 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  27.87 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  31.68 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  27.64 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  29 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  25.81 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
324 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  26.45 
 
 
188 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  29.79 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  28.03 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  30 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  27.48 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  28.93 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  22.31 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  30.85 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  33.94 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  30.3 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  29.03 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  25.81 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  25.81 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  29.76 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  26.53 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  26.26 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  26.73 
 
 
153 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  27.69 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  36.25 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  25.21 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>