23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1114 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1114  globin  100 
 
 
151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 
324 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  50.67 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  36.49 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.72 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  28.68 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  30.5 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  29.58 
 
 
599 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
263 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  28.67 
 
 
255 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  27.59 
 
 
257 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  26.98 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  27.81 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.51 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  31.67 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  24.22 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  31.13 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  37.29 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  32.48 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  33.07 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  28.07 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  35 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>