15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1095 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1095  globin  100 
 
 
150 aa  310  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  52 
 
 
151 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
324 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  38.03 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.66 
 
 
252 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  31.69 
 
 
257 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  31.94 
 
 
599 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  32.39 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  31.69 
 
 
255 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.93 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  31.47 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  30.28 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  36.25 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  29.57 
 
 
274 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  34.85 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>