84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3850 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  71.26 
 
 
255 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.02 
 
 
252 aa  333  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  58.91 
 
 
257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  57.05 
 
 
599 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  51.66 
 
 
153 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  47.92 
 
 
161 aa  138  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  40.54 
 
 
152 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.88 
 
 
316 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  36.3 
 
 
146 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  35.65 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  29.22 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  32.54 
 
 
133 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  33.33 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  34.62 
 
 
125 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  33.33 
 
 
130 aa  59.3  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  31.97 
 
 
142 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  31.97 
 
 
142 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  29.46 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  29.46 
 
 
149 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  28.03 
 
 
178 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  29.93 
 
 
150 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  30.65 
 
 
188 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  32.98 
 
 
149 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
101 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  36.52 
 
 
121 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  30.43 
 
 
132 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  32.08 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  27.78 
 
 
150 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  30.69 
 
 
123 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
100 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  29.81 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  32.38 
 
 
127 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
115 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  28.7 
 
 
129 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  29.57 
 
 
127 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  30.77 
 
 
129 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  31.58 
 
 
124 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  32.73 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  29.73 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  27.69 
 
 
135 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  26.5 
 
 
129 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  29 
 
 
133 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  29.29 
 
 
148 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  30.33 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  31 
 
 
127 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  27.72 
 
 
129 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  28.07 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.47 
 
 
124 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
101 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  29.63 
 
 
139 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
100 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  33.91 
 
 
137 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  40.68 
 
 
119 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  33.64 
 
 
126 aa  45.4  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  30.11 
 
 
124 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  34.38 
 
 
124 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
100 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  27.2 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  29 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  30.3 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
99 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  30 
 
 
173 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.1 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
99 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  29.9 
 
 
132 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  30.51 
 
 
136 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  29.9 
 
 
132 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  30.09 
 
 
142 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  29.91 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  27.91 
 
 
133 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  25.6 
 
 
131 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  29.41 
 
 
141 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  25.6 
 
 
131 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  25.6 
 
 
131 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  32.77 
 
 
139 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  30.4 
 
 
136 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  29.66 
 
 
136 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  32.91 
 
 
134 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
114 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  27.35 
 
 
141 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>