46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2864 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
99 aa  204  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  97.98 
 
 
99 aa  200  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.93 
 
 
99 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.72 
 
 
99 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.55 
 
 
99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.12 
 
 
100 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.54 
 
 
99 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  55.1 
 
 
100 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.06 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.17 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.29 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.17 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.52 
 
 
100 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 
99 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.88 
 
 
114 aa  95.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  44.79 
 
 
96 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.8 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.42 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.26 
 
 
100 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.4 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.16 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.41 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.31 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.11 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  28.42 
 
 
257 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  30.53 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>