49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3109 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 100 aa  209  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4588  hypothetical protein  92.86 
 
 		 100 aa  174  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.816951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.66 
 
 		 100 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2699  antibiotic biosynthesis monooxygenase  87.76 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2710  antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.66 
 
 		 100 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.04 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.42 
 
 		 100 aa  143  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.02 
 
 		 99 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.22 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.16 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.12 
 
 		 99 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  55.21 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4704  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.21 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3856  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51 
 
 		 100 aa  110  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.12 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.04 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2814  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  hitchhiker  0.0000016777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2130  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.48 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00717432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.55 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2761  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.12 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.83 
 
 		 93 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.83 
 
 		 93 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3494  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.41 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0268103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.39 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3369  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1129  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.818332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0131  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.35 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21400  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.62 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1731  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.714841  normal  0.694761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3336  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  30.11 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  30.14 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  26.67 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10750  extracellular polysaccharide biosynthesis protein  37.29 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.857641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>