149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5004 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 93 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.16 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.54 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  28.41 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  37.04 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.12 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  24.47 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  30.68 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  30.68 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  28.26 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.68 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  27.85 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  29.49 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  34.15 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.11 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.11 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.1 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.1 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  23.4 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>