156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2512 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  88.42 
 
 		 95 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.11 
 
 		 95 aa  133  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.61 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.09 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.09 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  51.09 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  51.09 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  43.24 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  40.26 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  41.25 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  43.66 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  36.25 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  31.18 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  36.76 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  39.44 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  37.31 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35.23 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  40.98 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  40.98 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  40.98 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  34.18 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.11 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  31.65 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  30.11 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  39.34 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  34.41 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>