205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3498 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  206  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.9 
 
 		 99 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.55 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.52 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.02 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  47.42 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.36 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.19 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.79 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.03 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.5 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.91 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  30.26 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  32.56 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  31.87 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.37 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  37.68 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  33.8 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0408  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0178675  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  36.62 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  28.17 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 115 aa  48.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  31.94 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>