79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3875 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  95.05 
 
 		 101 aa  200  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.51 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  36.63 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  35.64 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.05 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.07 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  30.69 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.49 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.28 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 		 103 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  24.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.51 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 94 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>