165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2954 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.16 
 
 
100 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.05 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  62.77 
 
 
96 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.04 
 
 
96 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.78 
 
 
96 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.99 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  54.84 
 
 
96 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.61 
 
 
95 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  42.22 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.48 
 
 
96 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.37 
 
 
94 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.48 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.18 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.71 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.71 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.08 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  35.48 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.76 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  35.48 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  43.37 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.84 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  38.71 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.84 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  33.73 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.18 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  29.41 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  34.67 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  35.53 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  31.91 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.79 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
95 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
95 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
98 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1390  hypothetical protein  57.5 
 
 
41 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.391611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  28.75 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  38.46 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.25 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.11 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  43.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>