231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2380 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  38.78 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 94 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.1 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.08 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  38.55 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.27 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  33.71 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  38.27 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  31.51 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  27.71 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40.35 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40.35 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.35 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  32.93 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.51 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  30.26 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.55 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  36.67 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>