174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002899 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  193  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  58.51 
 
 
94 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.45 
 
 
96 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.48 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.2 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  39.53 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  38.2 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  36.05 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  33.75 
 
 
103 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.37 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.37 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.31 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.71 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.71 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.47 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  30.86 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  44.26 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  29.27 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  28.74 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  44.23 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  44.23 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.23 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.35 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.63 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.62 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.98 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  39.06 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.27 
 
 
97 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  30.49 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>