104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4266 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  39.77 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  45.9 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  38.27 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.03 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.95 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 102 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.95 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.94 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.94 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  33.78 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.49 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  34.67 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 97 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 104 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  47.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.5 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  29.89 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  26.97 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  33.85 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.76 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  30.43 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.96 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.96 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 95 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.26 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>