213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4657 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 104 aa  214  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  93.27 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.31 
 
 		 104 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  87.5 
 
 		 104 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.04 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.58 
 
 		 98 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.76 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.78 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.39 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  39.56 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  42.65 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.25 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  30.59 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  33.77 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  39.74 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  41.18 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.12 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  29.11 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  38.36 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  38 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.23 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  30.59 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.1 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.66 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.32 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>