191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0257 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.74 
 
 		 96 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.69 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  48.42 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.96 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.43 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.05 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.32 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.32 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.48 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.9 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.75 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  46.67 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.66 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.36 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.26 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.26 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  39.02 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  29.03 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.53 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.23 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.43 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0251  hypothetical protein  48.48 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430256  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  31.17 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.03 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.25 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.03 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  37.66 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  30.56 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>