160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4239 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  202  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.54 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.25 
 
 
96 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.21 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
100 aa  91.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.39 
 
 
95 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  42.39 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  39.58 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.54 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  40.48 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.77 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.06 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.35 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  37.65 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  27.17 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  34.52 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.43 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.12 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03780  expressed protein  35.29 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.358269  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.72 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.66 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  32.35 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  34.94 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.86 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.86 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.48 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6125  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  25.53 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  25.53 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  25.53 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.22 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  25.53 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  25.53 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  25.61 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.46 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  26.6 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>