153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0437 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.76 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.93 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  29.35 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
97 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  29.63 
 
 
96 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  35.9 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.39 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  31.76 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.1 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.1 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
97 aa  48.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  24.73 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.59 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.29 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
111 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.31 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  32.56 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  31.25 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.99 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  25.58 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  30 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  30 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  30.21 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.4 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.4 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.4 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  28.4 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>