39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3536  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.4 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 		 99 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 100 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 99 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 99 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 99 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 99 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.18 
 
 		 96 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.18 
 
 		 96 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.18 
 
 		 96 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 99 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.63 
 
 		 99 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.59 
 
 		 99 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  28.04 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 99 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3761  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.67 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 		 99 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 		 99 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  25.58 
 
 		 98 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 		 96 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 96 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  28.75 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 		 99 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  24.69 
 
 		 95 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 95 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.38 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.71 
 
 		 97 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 		 97 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  31.43 
 
 		 101 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>