116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2308 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  41.1 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
99 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  37.04 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  38.36 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  38.36 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  37.04 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  37.04 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  38.36 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  37.04 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.79 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  35.8 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  37.84 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  27.96 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  27.96 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  38.36 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  28.74 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  40.85 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  34.33 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.88 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.67 
 
 
102 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  39.34 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  30.14 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1923  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.79 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  29.27 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  42.62 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.54 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  31.82 
 
 
254 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
95 aa  43.5  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  30.26 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  30.53 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>