85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1600 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.48 
 
 
106 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.75 
 
 
110 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.98 
 
 
108 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  63.21 
 
 
106 aa  149  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  61.32 
 
 
106 aa  144  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.75 
 
 
108 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 
106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.21 
 
 
109 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  60.38 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.29 
 
 
106 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.11 
 
 
107 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  49.04 
 
 
107 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  48.08 
 
 
107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.57 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.08 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.21 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  29.55 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
110 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  30.23 
 
 
95 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  32.89 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  32.95 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  29.55 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  32.26 
 
 
254 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
101 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  25.29 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1263  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.77 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  31.46 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  30.26 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.08 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>