109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0538 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  86.79 
 
 
106 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.76 
 
 
106 aa  150  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.67 
 
 
107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  62.62 
 
 
107 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  59.81 
 
 
107 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  61.68 
 
 
107 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  56.19 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.6 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.29 
 
 
112 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.34 
 
 
108 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  54.29 
 
 
106 aa  124  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.83 
 
 
110 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
109 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  104  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.43 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  32.56 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.8 
 
 
99 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  34.09 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.09 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  30.11 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  31.33 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  32.88 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  31.33 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  30.19 
 
 
272 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  31.71 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.28 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
100 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  31.51 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  30.49 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  37.84 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  26.44 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.18 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  32.93 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
99 aa  43.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.6 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  29.73 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  29.41 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.74 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
99 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  29.89 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>