75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6175 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  44.44 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.67 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.21 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  29.21 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  30.95 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.73 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 		 99 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.68 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.66 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.92 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  24.1 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>