58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3411 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  99.1 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.09 
 
 		 111 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.09 
 
 		 111 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.09 
 
 		 111 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.09 
 
 		 111 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  86.49 
 
 		 111 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.37 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.78 
 
 		 114 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.35 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.52 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  34.15 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  37.84 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.1 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  32.39 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.94 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 98 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  34.62 
 
 		 107 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  27.72 
 
 		 99 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  34.33 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  28.74 
 
 		 112 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>