62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  221  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  78.3 
 
 
106 aa  174  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.32 
 
 
112 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.95 
 
 
106 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.05 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.19 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.66 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.49 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.21 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  52.83 
 
 
107 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  53.27 
 
 
107 aa  117  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  47.62 
 
 
107 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  46.67 
 
 
107 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.71 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  31.82 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  28.72 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  29.11 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.88 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.49 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.88 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.88 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.08 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  25.84 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
97 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>