108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2068 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  42.68 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.46 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  40.24 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  40.24 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.47 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  30.68 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  27.96 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  31.82 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  29.55 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  28.41 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  32.58 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  28.72 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.85 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.84 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  31.51 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.4 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  26.44 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  27.14 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  27.16 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  26.14 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  24.47 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.47 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.14 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  28.09 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  26.58 
 
 		 95 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 		 99 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  26.58 
 
 		 95 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.36 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.84 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.64 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.64 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>