100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1439 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
98 aa  201  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  38.46 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.11 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.81 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.89 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.37 
 
 
104 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.37 
 
 
104 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
95 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.19 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  54.05 
 
 
98 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  31.67 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  28.09 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.22 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.22 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.22 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  28.41 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  29.55 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.62 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.68 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  32.88 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  44.44 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  37.74 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  27.78 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  28.75 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  25.84 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  27.27 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.91 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0807  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.91 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3068  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.48 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0144  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.59 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
96 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2223  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000613691  normal  0.28556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.19 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  26.19 
 
 
96 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 
103 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>