51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3393 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  193  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.21 
 
 
98 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.45 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.16 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.76 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  37.89 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1061  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
105 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0397481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
96 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  30.34 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  29.21 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  28.72 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  31.76 
 
 
112 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.92 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  27.08 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.2 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  26.32 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.76 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  24.21 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.35 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  32.61 
 
 
104 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
103 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.2 
 
 
97 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  31.87 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  31.03 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  31.03 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>