110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1741 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  99 
 
 
100 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.79 
 
 
100 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.78 
 
 
100 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.79 
 
 
100 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.12 
 
 
97 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67 
 
 
100 aa  140  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.36 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  38.64 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.82 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.07 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  39.76 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.24 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.24 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.94 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.94 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.94 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.94 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.94 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.23 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.56 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  42.42 
 
 
272 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
115 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.46 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  42.59 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.4 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.12 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  38.89 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  26.15 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.7 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.62 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  34.21 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.95 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  28.24 
 
 
107 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1905  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.78 
 
 
226 aa  42  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  30.88 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  24.29 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.35 
 
 
95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 
80 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  31.58 
 
 
107 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  33.73 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  25.56 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  27.78 
 
 
485 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1552  hypothetical protein  23.53 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342709  normal  0.350764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>