36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3087 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55 
 
 
129 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 
148 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.39 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1805  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.79 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874842  normal  0.0169557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.35 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  27.91 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  28.05 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2026  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.06 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1905  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.79 
 
 
226 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.78 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.22 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  29.07 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.08 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.17 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  32.69 
 
 
213 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>