39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0840 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.96 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.5 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.21 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.83 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1805  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874842  normal  0.0169557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  30.95 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  28.95 
 
 		 598 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2026  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.26 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1905  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.9 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.81 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.83 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  37.74 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>