60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0875 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.48 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  48.51 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.51 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146325  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0258  hypothetical protein  40.66 
 
 		 485 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0545  hypothetical protein  42.17 
 
 		 598 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2721  hypothetical protein  42.47 
 
 		 415 aa  67.4  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.632989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4443  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 		 442 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  27.37 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  27.96 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4354  hypothetical protein  42.11 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.1 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.63 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  31.46 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  29.58 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  31.76 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1061  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 		 96 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.24 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>