116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1842 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  87.5 
 
 
96 aa  177  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.53 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.75 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.57 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.45 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.82 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  40.28 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
96 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.67 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  35.53 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 
99 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  35.29 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.39 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.39 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  41.94 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1061  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
105 aa  43.5  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0397481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.8 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  25.26 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.63 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.26 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
103 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  32.08 
 
 
67 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
95 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  35.62 
 
 
117 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>