24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1468 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  274  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  89.92 
 
 
129 aa  251  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1552  hypothetical protein  88.37 
 
 
129 aa  246  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342709  normal  0.350764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15071  hypothetical protein  67.44 
 
 
129 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0788151  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14291  hypothetical protein  71.43 
 
 
128 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0616  hypothetical protein  69.84 
 
 
128 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.501171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12171  hypothetical protein  71 
 
 
101 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17800  hypothetical protein  29.52 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
104 aa  40.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  30.16 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.2 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>