18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1552 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1552  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  271  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342709  normal  0.350764 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  90.7 
 
 
129 aa  256  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  88.37 
 
 
130 aa  246  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15071  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  193  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0788151  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14291  hypothetical protein  70.87 
 
 
128 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0616  hypothetical protein  69.29 
 
 
128 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.501171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12171  hypothetical protein  71 
 
 
101 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17800  hypothetical protein  27.62 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  23.53 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>