29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0549 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  271  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1552  hypothetical protein  90.7 
 
 
129 aa  256  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342709  normal  0.350764 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  89.92 
 
 
130 aa  251  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14291  hypothetical protein  73.23 
 
 
128 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15071  hypothetical protein  68.22 
 
 
129 aa  196  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0788151  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0616  hypothetical protein  71.65 
 
 
128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.501171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12171  hypothetical protein  73 
 
 
101 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
100 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17800  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
97 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  26.15 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.85 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  24.62 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
104 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>