124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3619 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
103 aa  209  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 
100 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.02 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.86 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.34 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.7 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  39.53 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.96 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  38.37 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  42.67 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.17 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.53 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.33 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.24 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  45.59 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  41.67 
 
 
97 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  41.67 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  41.67 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  41.67 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  43.08 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  41.67 
 
 
272 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.29 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.74 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
106 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
104 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
99 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.67 
 
 
108 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  34.38 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.7 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
252 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.9 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  38.24 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  29.55 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.81 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  31.4 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  34.72 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  26.97 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.62 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  28.4 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  27.27 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12171  hypothetical protein  48 
 
 
101 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2026  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  40 
 
 
97 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>