39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.08 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.28 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.89 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.47 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.29 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.29 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.29 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  30.86 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.48 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.48 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.48 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.48 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.48 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  42.59 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.15 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  35.38 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.73 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 107 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  36.51 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>