131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0564 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
110 aa  217  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  83.33 
 
 
109 aa  176  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0873  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.83 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.32 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.39 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.87 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.57 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.87 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.59 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  39.36 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.59 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  38.3 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.53 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  40.24 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0549  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.989851  normal  0.727681 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1552  hypothetical protein  38.57 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342709  normal  0.350764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
104 aa  53.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
97 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.26 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  36.56 
 
 
272 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  39.02 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.93 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15071  hypothetical protein  34.15 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0788151  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  32.95 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  28.92 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
96 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
106 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
112 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 
99 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
101 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.68 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.68 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
104 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.68 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.59 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0616  hypothetical protein  29.21 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.501171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
252 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1527  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14291  hypothetical protein  29.21 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.18 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.18 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.78 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.78 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  27.71 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  37.76 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.16 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.52 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.22 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804464  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.52 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
110 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  44.19 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0203  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.328861  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  29.52 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  29.52 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  29.52 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>