121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3507 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
102 aa  215  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  45.26 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
97 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
97 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.95 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.95 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.95 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.95 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.89 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.89 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.84 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  32.05 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  35.62 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  31.87 
 
 
272 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.62 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0469  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  37.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  30.88 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  29.33 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.85 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  30.67 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  30.86 
 
 
98 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
107 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  31.51 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  33.67 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.6 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.29 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.29 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  32.39 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4551  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.87 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.86 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2723  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.26 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.86 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>