56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2140 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  98.96 
 
 		 96 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 		 109 aa  169  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 		 97 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 		 97 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  75 
 
 		 97 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  75 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  75 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  75 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  69.79 
 
 		 97 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  56.25 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.89 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  34.04 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  42.68 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  37.88 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  36.76 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  36.36 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  28.92 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  33.73 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  28.92 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  28.92 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 		 95 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  20.73 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.62 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>