71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0491 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  50.48 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.38 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  50.48 
 
 
272 aa  99  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.42 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
97 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.42 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.42 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  35.42 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
97 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.17 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  34.38 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.47 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3497  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.37 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.116847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.94 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  36.36 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.08 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.85 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03750  hypothetical protein  31.43 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.99639  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.03 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.48 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  24.73 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.03 
 
 
99 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  23.66 
 
 
97 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  22.58 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  23.66 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  28.77 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  21.51 
 
 
97 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>