84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4062 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.33 
 
 
114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.34 
 
 
111 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.35 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.35 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.35 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.36 
 
 
111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.37 
 
 
111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.39 
 
 
111 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.68 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.53 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  35.14 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.65 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.37 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.39 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.62 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.62 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  27.54 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  28.17 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.86 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.49 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  27.54 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
96 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  31.76 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  29.55 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  32.53 
 
 
94 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  27.78 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.47 
 
 
108 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.35 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
108 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
108 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
108 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
108 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>