97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0526 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
108 aa  225  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  97.22 
 
 
108 aa  222  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  96.26 
 
 
108 aa  215  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.67 
 
 
108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.67 
 
 
108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.67 
 
 
108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.67 
 
 
108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  91.59 
 
 
108 aa  208  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.72 
 
 
108 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  77.14 
 
 
105 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.15 
 
 
105 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.9 
 
 
95 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
115 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.14 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
129 aa  48.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  39.34 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
96 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  37.66 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.59 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  31.17 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.59 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.21 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.93 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  29.76 
 
 
106 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
99 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.93 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.07 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.99 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.51 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  32.86 
 
 
99 aa  40.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  22.22 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  38.18 
 
 
96 aa  40  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 
99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.31 
 
 
95 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>